Мистер Икс, новый богатый покровитель робототехники, организует глобальный турнир роботов, который оказывается ловушкой для захвата мирового господства. Игра впервые официально поддерживает адаптер для 4 игроков, а её уровни отличаются ярким и оптимистичным дизайном. Несмотря на то, что она стала коммерчески менее успешной, «Mega Man 6» завершает эпоху NES достойно, предлагая увлекательный и красочный экшен.